אך לפעמים הדרש חולק על הפשט, לפעמים הגמרא חולקת על פיסוק הטעמים, לפעמים הכתיב חולק על הטעמים.

ראה במסכת בבא מציעא דף עג ע"ב "שפיר קא עבדת" שנפסק להלכה בגמ' רמב"ם ושו"ע כשני אופנים הפוכים, גם כטעמים וגם בניגוד גמור אליהם.