כל ענין הסימנים , עפ"י השל"ה רומז לסודות גדולים ואלו דבריו :

"וראיתי הרבה בני אדם כשיש סימן בגמרא אין לומדים הסימן ואין קורין אותו. וחלילה לעשות כן! ואני חושב כי סודות גדולים מרומזים בסימנים, נוסף על הפשוטו מה שמורה הסימן ... והנה זמן ארוך מאד , נצטערתי במאד על סימן אחד בשבת פרק 'במה מדליקין' דף ל"ד , שלא הבנתי אותם ונעלם כמעט מעיני כל חי , עד שזכיתי תודה לאל וקיבלתי פירושו" (תושבע״פ, כלל יג אות סמ״ך סימנין דאורייתא)