באר שבע (סנהדרין צב):
אל תטעה לחשוב שזה אליהו הוא אליהו הנביא התשבי אלא הוא התנא הרשום בהקדמת זרעים להרמב"ם ז"ל אצל חוני המעגל סוף פרק ז' ובפרק מי שהיה תמצא תנא דבי אליהו רבי נתן אומר כל הישוב תחת כוכב אחד וכו':

אך מהערוך (ערך סדר) משמע אחרת:
סדר אליהו רבה וסדר אליהו זוטא בר"ג דפ' ב' דייני גזילות (כתובו' ק"ו.) פי' משניות חיצונות הן ורבה הוה ג' בבי ול' פירקין וזוטא י"ב פירקי ודאמרי בגמרא (שבת י"ג. פסחי' צ"ד. קי"ב. מגיל' כ"ח: קידוש' פ': ע"ז ה': ט'. סנהד' צ"ב. צ"ז. אבדר"נ פ"ב תמיד ל"ב: נדה ע"ג.) תנא דבי אליהו כולהון בגווייהו.