מדוע בכל השנים מימות יחזקאל עד ימיו של חנניה לא הטרידו הסתירות בספר יחזקאל את החכמים ורק בימיו 'נזכרו' שצריך לישבן.
ועוד קשה, הרי בוני בית שני לא בנוהו לפי הכתוב בספר יחזקאל ומשמע שיש בו דברים סתומים ובלתי מובנים והם נשארו כאלה גם אח"כ. מדוע את הדברים הסתומים לא באר חנניה ורק דרש את הסתירות לסלקן ?
ועוד, הבה נניח שחנניה לא היה מצליח במלאכתו והיו גונזים את ספר יחזקאל. כיצד היה ניתן לבנות את ביהמ"ק השלישי בהעדר ספר יחזקאל שתוכנית הבניין כתובה רק בו, ולא עוד אלא גם חלוקת הארץ לנחלות והנהגות הנשיא והכהנים וכדו' דברים רבים הנוגעים לעת"ל, אם כן מניין בכלל הרעיון לגנוז ספר נבואה זה, הרי זה דבר בלתי סביר בעליל ?